El Junior Fútbol Club sub-20 es un equipo de fútbol profesional colombiano con sede en la ciudad de Barranquilla, Atlántico. Es la filial juvenil del Junior Fútbol Club, que participa en la Categoría Primera A del fútbol colombiano. El equipo fue fundado en el año 2008 y desde entonces ha sido uno de los más exitosos de su categoría, ganando varios títulos nacionales e internacionales.

El Junior sub-20 ha ganado la Copa Colombia Juvenil en dos ocasiones, en los años 2010 y 2012. También ha ganado el Torneo Nacional Sub-20 en tres ocasiones, en los años 2011, 2013 y 2015. A nivel internacional, el equipo ha ganado la Copa Libertadores Sub-20 en dos ocasiones, en los años 2013 y 2015.

El Junior sub-20 ha sido un semillero de talentos para el fútbol colombiano, y muchos de sus jugadores han llegado a jugar en la selección nacional de Colombia. Algunos de los jugadores más destacados que han salido de la cantera del Junior sub-20 son:

* Teo Gutiérrez
* Carlos Bacca
* James Rodríguez
* Juan Cuadrado
* Radamel Falcao García

El Junior sub-20 es uno de los equipos más prometedores del fútbol colombiano, y seguramente seguirá dando de qué hablar en los próximos años.