La selección de fútbol sub-17 de Estonia Femenino es el equipo nacional de fútbol femenino de Estonia para jugadoras menores de 17 años. Es controlada por la Asociación Estonia de Fútbol y se encuentra afiliada a la UEFA. El equipo compite en el Campeonato Europeo Femenino Sub-17 de la UEFA y la Copa Mundial Femenina de Fútbol Sub-17 de la FIFA.

Estonia Sub-17 Femenino ha participado en 10 ediciones del Campeonato Europeo Femenino Sub-17 de la UEFA, pero nunca ha logrado clasificarse para la Copa Mundial Femenina de Fútbol Sub-17 de la FIFA. Su mejor resultado en el Campeonato Europeo Femenino Sub-17 de la UEFA fue llegar a la fase final en 2013.

Algunas de las jugadoras más destacadas que han representado a Estonia Sub-17 Femenino son:

* Liis Lemsalu
* Getter Saar
* Kristina Bannikova
* Kristina Šeiko
* Viktoria Vassiljeva

El actual entrenador de Estonia Sub-17 Femenino es Martin Reim.